La commune de Parfondru est caractéristique du rebord de la cuesta de l’Ile de France. Du sud au nord, la diversité du sous-sol, des calcaires du Lutétien aux sables du Thanétien, supporte une grande variété de milieux qui contraste avec la plaine crayeuse située plus au nord. C’est le domaine en particulier des forêts de feuillus à fougères, aux ambiances sub-montagnardes, des marais de pentes...